大概因为没有了迷宫的缘故，本部没有第一部那么紧张和精彩了。迷宫外面的人感染病毒变成了僵尸，具有传染性的。托马斯、特蕾莎和其他小伙伴被接进了庇护所，和很多小伙伴一样被管理，管理的机构叫维克德，众多的小伙伴都是病毒的免疫者，维克德试图研究他们获得疫苗。托马斯和朋友一次误闯入庇护所的实验室，发现很多小伙伴被像烤鸭一样挂着，被抽干了血。维克德眼里只有利益和疫苗，他们做事不管什么人道不人道。
于是托马斯带着死党小伙伴跑出了庇护所，他们一边躲避维克德的追捕，一边逃离耀斑僵尸的猎杀，目的就是要找到躲在山里的正义之军。路途中又有两个朋友加入，后来终于找到解救青少年的正义之军。
没有料到，特蕾莎竟然是维克德的卧底，向维克德报了信，几架直升机飞来，与正义之军大战一场。托马斯伤心特蕾莎骗他，又看到小伙伴珉豪被维克德捉走，下定决心带着剩余的人去拯救。
